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一般的观点认为，慢性附睾炎可由急性附睾炎迁延而成，但多数病人并无急性发作史。

根据病因慢性附睾炎分为三类。

第一类，慢性炎症性附睾炎，指伴有异常肿胀、硬结及其他炎症表现的疼痛或不适。该类又分为六个亚型，包括感染性(如衣原体)、感染后性(如急性细菌性附睾炎的迁延不愈)、肉芽肿性(如结核病)、药物诱导性(如胺碘酮)、综合征相关性(如Behcet病)以及特发性(如无明确病因的炎症);

第二类，阻塞性慢性附睾炎，指伴有先天性、获得性或医源性的附翠或输精管梗阻所致的疼痛或不适(如先天性梗阻或输精管结扎术后瘫痕形成);

第三类，慢性附睾痛，指触诊附睾形态质地正常，无明确病因的附睾痛或不适。